1947. aastal teaduskeskus reorganiseeriti: iseseisev instituut likvideeriti, asutus hakkas alluma Teaduste Akadeemiale ning vahetas nime. Teaduskeskus sai nimeks Põllumajanduse (hiljem Taimekasvatuse) Instituudi Polli filiaal. Sel ajal kivideeriti kõik katsepunktid peale Karja katsepunkti Saaremaal. Maavaldusi laiendati võõrandatud talumaade arvel, aedade pind oli kokku 650 ha. 1953. aastal lõpetati teaduskeskuses köögiviljandusalane teadustöö. Sel ajal lõppes ka iluaiandusalane teadustöö, kuid 1962.–1972. aastal tegeleti sellega Pollis taas.
1956. aastal muudeti uuesti teaduskeskuse nimetust ja alluvust. Endise nimega instituut nimetati ümber Eesti Maaviljeluse ja Maaparanduse Teadusliku Uurimise instituudi Polli katsebaasiks ning allutati Põllumajandusministeeriumile[[Eesti NSV Põllumajandusministeerium]]ile.1957. aastal alustati teadustööd marjaaedade agrotehnika suunal. 1960. aastal suurenesid katsemajandi maavaldused, kui instituudiga maadele liideti juurde endise Edu kolhoosi maad, aedade kogupind oli 1553 ha. Uurimisasutus tegeles lisakaslisaks puuvilja- ja marjakasvatusele ka piimakarjakasvatuse ning teravilja ja kartuli seemnekasvatusega. 1961. aastal alustati puuvilja- ja marjakultuuride sortide viljade tehnoloogiliste omaduste selgitamist. 1963. aastal lisandus uurimisvaldkonnana taliõunte[[taliõun]]te säilitamine, see on tänaseks lõpetatud (1963–1988). 1968.–1988. aastal uuriti teaduskeskuses puuviljasortide ja pookealuste valkude ning isofermenide geneetilise sugulust. 1986. aastal avati viljapuude meristeempaljunduse[[meristeem]]paljunduse uurimisvaldkond, ka see uurimistöö on lõpetatud.
1991. aastal lõpetati mesindusalane teadustöö.
1995. aastal anti teaduskeskus üle [[Eesti PõllumajandusülikoolilePõllumajandusülikool]]ile ning muutis endise nime EPMÜ Polli Aianduse Instituudiks. Kuna katsejaamal olid tekkinud majanduslikud raskused, siis suurem osa varast erastati ning lõpetati põllukultuuride tootmine ja loomakasvatus. Teaduskeskuse valdusse jäid Polli aianduskooli koolitalu maad. Pollis tegeletakse ainult puuviljandusalase uurimistööga. <ref>Haak, E. (1995). Pool sajandit aianduslikku teadustööd Pollis. 1–3 lk.</ref>
2005. aastal, kui Eesti Maaülikoolis loodi põllumajandus- ja keskkonnainstituut, siis hakkas Polli teaduskeskus kandma nime Polli Aiandusuuringute Keskus.
