Transkriptsioon (geneetika): erinevus redaktsioonide vahel

Eemaldatud sisu Lisatud sisu
P Nobeli preemia > auhind
subühik -> alaühik
38. rida:
Eukarüootides vajab RNA polümeraas ja tänu sellele ka transkriptsiooni initsiatsioon DNA promootori järjestuse olemasolu. Promootorid on DNA regioonid, alguskohad, tänu millele algab transkriptsioon ja mis asuvad eukarüootides 30, 75 ja 90 aluspaari enne transkriptsiooni alguskohta. Promootoris olevad järjestused on transkriptsiooni initsiatsiooni jaoks hädavajalikud. Enne kui süntees algab, peab RNA polümeraas seonduma DNA kindla piirkonnaga, mida kutsutakse geeni promootoriks. Seondumine toimub kindlate transkriptsioonifaktorite juuresolekul. Lisafaktorid, mis aitavad RNA polümeraasil seonduda, ei osale hilisemal ahela pikendamisel (elongatsioonil).<ref>Lewin B. Genes VII, New York: Oxford University Press, 1999.</ref>
 
Kõige rohkem iseloomustatud promootori tüüp on eukarüootides lühike DNA järjestus, mida nimetatakse TATA järjestuseks, mis asub 25–30 aluspaari enne transkriptsiooni alguskohta (''upstream''). TATA järjestus on TATA-seonduvale valgule (inglise k ''TATA-binding protein'' (TBP)) seondumiskohaks. TBP on ise subühikuksalaühikuks teisele [[transkriptsioonifaktor]]ile, Transkriptsioonifaktor II D'le (TFIID). Pärast TFIID seondumist TATA järjestusele, läbi TBP, ühinevad TATA järjestuse ümber veel viis transkriptsioonifaktorit ja RNA polümeraas. Tekkivat kompleksi nimetatakse preinitsiatsiooni kompleksiks. Ühel transkriptsiooni faktoril, [[DNA helikaas]]il, on helikaasne aktiivsus ning on seetõttu seotud kaheahelalise DNA ahelate eraldamisega, tagamaks ligipääsu üheahelalisele matriits DNA-le. Teised valgud, aktivaatorid ja repressorid vastutavad koos erinevate seotud koaktivaatorite või korepressoritega transkriptsiooni moduleerimise taseme eest.<ref>http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC24122/?tool=pmcentrez.</ref>
 
Seega sisaldab preinitsiatsiooni kompleks
53. rida:
[[Pilt:Simple transcription initiation1.svg|pisi|Lihtne joonis transkriptsiooni initsiatsioonist]]
 
Bakterites algab transkriptsioon RNA polümeraasi seondumisega DNA promootorile. RNA polümeraas on tuumikensüüm (tuumikensüüm koosneb ensüümi allüksustest, mida on vaja katalüütiliseks aktiivsuseks), mis koosneb viiest subühikustalaühikust: 2 α subühikutalaühikut, 1 β subühikalaühik, 1 β' subühikalaühik ja 1 ω subühikalaühik. Initsiatsiooni alguses on tuumikensüüm ühendatud sigma faktoriga, mis aitab leida õiged −35 ja −10 aluspaarid allpool (downstream) promootorjärjestust.<ref>http://www.ebc.ee/GENEETIKA/loengud/Presentation10.pdf.</ref>
 
Eukarüootides on transkriptsiooni initsiatsioon keerulisem. Eukarüootne RNA polümeraas ei tunne otseselt tuumikpromootorjärjestust ära. Selle asemel vahendavad transkriptsioonifaktorid RNA polümeraasi seondumist ja transkriptsiooni initsiatsiooni. Alles pärast kindla transkriptsioonifaktori ühendumist promootorjärjestusele seondub RNA polümeraas sellele. Täielik kogum, mis seondub promootorile, moodustades transkriptsiooni initsiatsiooni kompleksi, koosneb transkriptsioonifaktoritest ja RNA polümeraasist. [[Arhed]]e transkriptsiooni domeen on sarnane eukarüootide omaga.<ref>http://chemistry.about.com/od/biochemistry/ss/transcription_4.htm</ref>