Keminformaatika

Keminformaatika (tuntud ka kui kemoinformaatika) on füüsikalise keemia haru, mis tegeleb arvutiteaduse võimaldatud tehnikate ja andmevõtumeetodite (nn in silico tehnikad) rakendamisega keemilistes uuringutes, eelkõige uute ravimite väljatöötamisel.[1] Meetodeid saab kasutada ka keemiatööstuses ja sellega seotud tööstusharudes ning sellistes valdkondades nagu keskkonnateadused ja farmakoloogia, kus kasutatakse või uuritakse keemilisi protsesse.[2]

Liigendus

muuda

Andmebaaside loomine ja haldamine

muuda

Tarkvara keemiliste struktuuride andmebaasidega töötamiseks (salvestamine, väljavõtete tegemine):

  1. ISIS/Host, ISIS/Base (www.mdli.com)
  2. ChemFinder, ChemOffice (www.cambridgesoft.com)
  3. JChem (www.chemaxon.com)
  4. THOR (www.daylight.com)
  5. MOE (www.chemcomp.com)
  6. ICM Pro (mySQL) (www.molsoft.com)
  7. CheD (Сергей Трепалин)
  8. UNITY (www.tripos.com)
  9. OrChem (orchem.sourceforge.net)

Keemilist teavet sisaldavad avalikud andmebaasid:

  1. PubChem (pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)
  2. ZINC (zinc.docking.org)
  3. DrugBank (www.drugbank.ca)
  4. BindingDB (www.bindingdb.org)
  5. DUD (dud.docking.org)
  6. ChemSpider (www.chemspider.com)
  7. ChEMBL (www.ebi.ac.uk)
  8. ChEBI (www.ebi.ac.uk)

Viited

muuda
  1. "CHEMINFORMATICS | Meaning & Definition for UK English | Lexico.com". Lexico.com (inglise). Originaali arhiivikoopia seisuga 8. juuni 2022. Vaadatud 6. juunil 2022.
  2. Thomas Engel (2006). "Basic Overview of Chemoinformatics". J. Chem. Inf. Model. 46 (6): 2267–77. DOI:10.1021/ci600234z. PMID 17125169.

Kirjandus

muuda

Välislingid

muuda