Silmas pidades ajaloolist järjepidevust 1906–1944 tegutsenud Peetri kooliga, on MTÜ oluliseks koostööpartneriks EELK Tartu Peetri kogudus.
== Sümboolika ==
Peetri koolis kasutatakse Peetri kogudusega ühist vappi ja lippu.
Vapi [[Heraldika|heraldiline]] kirjeldus: punasel kilbil kuldse, hõbedaste kaantega avatud raamatu kohal kuldne [[ladina rist]]. Saateks kummalgi pool hõbedane võti.
Vapi kujundid sümboliseerivad [[Piibel|Pühakirjal]] rajanevat usku ning viitavad koguduse nimipühakule [[Apostel Peetrus|apostel Peetrusele]]. Vapivärvidest punane väljendab jumalikku armastust ja ohverdust; kuldne sümboliseerib taevalikku tõde ja igavest elu. Hõbedane on tarkuse, vaimsuse, puhtuse ja ustavuse tähis. Vapivärvid viitavad ka [[Tartu]]le.
Vapp on ka Peetri kooli ja [[Tartu Peetri kogudus|Peetri koguduse]] ühisel lipul<ref>[http://www.eelk.ee/~ktrtpeetri/lippjavapp.php Koguduse lipp ja vapp]. Tartu Peetri koguduse koduleht</ref>, mis järgib EELK lipu üldist standardit. Lipu õnnistas Peetri kooli avaaktusel 1. septembril 2013 [[peapiiskop]] [[Andres Põder]] [[Peetri kirik]]us.
Vapimotiive on kasutatud ka Peetri kooli koolimütsil ja -vormil.
