Ioonikanal: erinevus redaktsioonide vahel

Eemaldatud sisu Lisatud sisu
P pisitoimetamine
1. rida:
[[Pilt:Alamethicin ion channel.jpg|thumbpisi|[[Alametitsiin]]i ioonikanal]]
'''Ioonikanal''' ehk '''ioonkanal''' on [[Transmembraansed valgud|transmembraanne]] [[Valgud|valk]], kus membraani läbivatest [[Valk|valgumolekulidest]] moodustub kanal ehk poor. Ioonikanalid aitavad tekitada ja kontrollida [[Elektriline pinge|elektrilist]] [[Gradient|gradientigradient]]i läbi kõikide elus[[Rakk|rakkuderakk]]ude [[Rakumembraan|rakumembraanirakumembraan]]i (vt [[puhkepotentsiaal]]), võimaldades [[Ioon|ioonideioon]]ide liikumist mööda [[Elektrokeemia|elektrokeemilist]] [[Gradient|gradientigradient]]i (näit [[Närviimpulss|närviimpulsi]] teke ja ülekanne).<ref name="manZg" />
 
Ioonikanal avaneb (näiteks [[Ligand (biokeemia)|ligandi]] toimel) ning laseb perioodiliselt ja väga valikuliselt läbi teatud ioonid või ühe või mitu [[Anioon|anioonianioon]]i või [[Katioon|katioonikatioon]]i.
 
== Üldiseloomustus ==
8. rida:
* ioonikanalit läbivaid ioone on palju (miljon või enam iooni sekundis);<ref name="ce5aQ" />
* ioonid läbivad kanali mööda elektrilist gradienti, vajamata ATP kujul lisaenergiat ega mõnda muud mehhanismi.
Ioonikanalid paiknevad peaaegu kõikide [[Organism|elusorganismide]] rakkude rakumembraanides ja mitmes [[Organell|rakuorganellis]]. Valk moodustab kitsa ava läbi membraani, kust pääsevad läbi vaid kindla suuruse ja/või laenguga ioonid. Seda kutsutakse selektiivseks permeaabluseks ehk selektiivseks läbitavuseks. Tüüpiline ioonikanal on vaid ühe või kahe aatomi laiuse vahega oma kitsaimast kohast ning seda saavad läbivad vaid kindlat tüüpi ioonid, näiteks kaalium või naatrium. Mõned kanalid võivad olla aga läbitavad rohkem kui üht tüüpi ioonidele, kuid üldiselt peavad ioonid siiski sama laenguga olema: positiivsed katioonid või negatiivsed anioonid. Ioonid liiguvad läbi kanali üksteise järel tihti sama kiiresti kui mujal lahuses. Mitme iooni läbitavust reguleeritakse värava ehk tõkkega, mis avaneb ja sulgub reaktsioonina keemilisele või elektrilisele signaalile, temperatuurile või mehaanilisele jõule.
 
Ioonikanalid on integraalsed membraanivalgud, koosnedes tavaliselt mitmest valgust. Eri alaühikud ehk subühikud on tavaliselt homoloogilised või identsed ning paiknevad ringikujuliselt tihedalt üksteise kõrval, omavahel membraani läbivat poori moodustades. Pingeseoseliste ioonikanalite poori moodustavaid alaühikuid kutsutakse α alaühikuteks ning abistavaid alaühikuid tähistatakse β, γ jne.
 
== Bioloogiline roll ==
Ioonide reguleeritud ja selektiivne transport, mis toimub ioonikanalite kaudu, on aluseks mitmele fundamentaalsele füsioloogilisele protsessile. See hõlmab näiteks elektrisignaale [[Süda|südamessüda]]mes ja [[Närvisüsteem|närvisüsteemisnärvisüsteem]]is, neerude tööd ja [[Immuunsüsteem|immuunvastust]].<ref name="G3ffh" /> Palju [[Toksiin|toksiinetoksiin]]e on välja arenenud halvamaks saaklooma närvisüsteemi ioonikanaleid (näiteks ämblike ja madude mürgid). Need töötavad, muutes ioonikanali juhtivust ja/või kineetikat. Ioonikanalid on ka võtmeosaks mitmes bioloogilises protsessis, mis vajavad kiireid muutusi rakkudes, näiteks südame-, skeleti- ja [[Silelihased|silelihaste]] kokkutõmbed, [[Epiteelkude|epiteelkoes]] toitainete ja ioonide transport, [[T-lümfotsüüdid|T-lümfotsüütide]] aktivatsioon ja [[Kõhunääre|pankreases]] [[Insuliin|insuliiniinsuliin]]i vabastamine. Uute [[Ravim|ravimiteravim]]ite väljatöötamisel üritatakse mõjutada just ioonikanalite tööd.<ref name="Gdy28" /><ref name="l3mPN" /><ref name="lbpSK" /> ioonikanalite olulisust näitab ka see, et nad moodustavad tervelt 1,5% [[Inimese genoom|inimgenoomist]].<ref name="lFw7d" />
 
Teatud tüüpi kanalite alaühiku(te) puudumine või [[mutatsioon]] neis võib viia funktsiooni kadumiseni ja on põhjuseks mitmele [[Neuroloogia|neuroloogilisele]] ja teistele haigustele.
 
== Mitmekesisus ==
Elusrakkudes on üle 300 tüübi ioonikanaleid.<ref name="r5VKZ" /> Vastavalt läbilastavate ioonide laengule saab neid jagada katioonikanaliteks ja anioonikanaliteks. Veel saab neid jagada lekkivateks(ingl ''leakage'') kanaliteks, mis on pidevalt avatud ja tõkestatavateks (ingl ''gated'') kanaliteks, mida saab avada ja sulgeda vastava [[Ligand (biokeemia)|ligandi]] või muu mehhanismi abil. Kanaleid võib kategoriseerida ka tööpõhimõtte, arvu või valkude paiknemise järgi.
 
Ioonikanaleid saab edasi eristada, kui abistavad alaühikud tekitavad spetsiifilist tüüpi [[Elektrivool|voolu]].<ref name="vT7e2" />
 
=== Klassifikatsioon tõkestuse järgi ===
26. rida:
 
==== Pingeseoselised ioonikanalid ====
Rakumembraanil paiknev potentsiaalide erinevuse tekitatud [[elektriväli]] põhjustab ioonikanalis konformatsioonilisi muutusi, mis vastavalt [[Membraanipotentsiaal|membraanipotentsiaalilemembraanipotentsiaal]]ile avavad või sulgevad pingeseoselise ioonikanali.
* Pingeseoselised naatriumkanalid: pere sisaldab 9 liiget ja vastutab närviimpulsside tekkimise ja levimise eest. Poori moodustav α alaühik on suur ja koosneb neljast [[Homoloogia|homoloogilisest]] [[Domeen (struktuuribioloogia)|kordusdomeenist]]. Kanal koosneb ka abistavast β alaühikust.<ref name="2WMMq" /> Mõlemad alaühikud on tugevalt glükosüülitud.
* Pingeseoselised kaltsiumkanalid: pere sisaldab 10 liiget ja nad koosnevad α<sub>2</sub>δ, β ja γ alaühikutest. Kanalid on olulised nii lihasrakkude kokkutõmmetel, ergastamisel kui ka närvirakkude ergastamisel koos [[Neurotransmitter|virgatsaine]] vabastamisega.<ref name="5SHZt" />
32. rida:
* Mööduva retseptorpotentsiaaliga kanalid: perekonnaliikmeid on vähemalt 28 ning neid nimetatakse TRP (ingl ''transient receptor potential'') kanaliteks. See rühm kanaleid on väga mitmekesiste aktivatsioonimeetoditega. Mõned kanalid võivad olla konstitutiivselt avatud, samas teiste avatust reguleerivad pinge, rakusisene Ca<sup>2+</sup>, pH, [[Oksüdatsiooniaste|reduktsiooniaste]], [[osmolaarsus]] ja mehaaniline venitamine. Kanalid erinevad ka ioonide poolest, mida nad läbi lasevad. Mõned on selektiivselt Ca<sup>2+</sup> kanalid, teised on vähem selektiivsed, funktsioneerides katioonikanalitena.
* Hüperpolarisatsioon-aktiveeritud tsükliliste nukleotiidide tõkestatavad kanalid: kanalid avanevad hüperpolarisatsiooni mõjul, erinevalt teistest tsükliliste nukleotiidide tõkestatavatest kanalitest, mis avanevad depolarisatsiooni mõjul. Need kanalid on tundlikud tsüklilistele nukleotiididele cGMP (tsükliline guanosiinmonofosfaat) ja [[Tsükliline adenosiinmonofosfaat|cAMP]], mis mõjutavad kanali avanemise pingetundlikkust. Kanal on läbitav monovalentsetele K<sup>+</sup> ja Na<sup>+</sup> katioonidele. Peres on 4 liiget, millest kõik moodustavad tetrameere kuuekordselt membraani läbivatest α alaühikutest. Kuna kanalid avanevad hüperpolarisatsiooni tingimustes, funktsioneerivad nad südame rütmi hoidvate rakkude töös.
* Pingeseoselised prootonkanalid: kanalid avanevad depolarisatsioonil, aga on tugevalt pH-sõltuvad. Tulemusena avanevad kanalid vaid juhul, kui elektrokeemiline gradient on väljapoole ([[Tsütoplasma|tsütoplasmastsütoplasma]]s on positiivsem laeng kui väljaspool rakku), mille toimel liiguvad ainult prootonid rakust välja. Sellest tulenevalt on nende funktsioon happe väljutamine rakust. Veel on need kanalid kasutuses [[Fagotsüüt|fagotsüütidesfagotsüüt]]ides oksüdatiivse purske ajal.<ref name="u3Bzk" /> Kui fagotsüüt on neelanud mikroobi, siis [[ensüüm]] NADPH [[oksüdaas]] koondub membraani ja hakkab tootma reaktiivseid hapnikuühendeid, mis aitavad mikroobe surmata.
 
==== Ligandseoselised kanalid ====
41. rida:
* Mõned kaaliumkanalid:
** kaltsium-aktiveeritud kaaliumkanalid: pere 8 liiget aktiveerib peamiselt rakusisene Ca<sup>2+</sup>;
** kahe poori domeeniga kaaliumkanalid: enam kui 15 liikmest koosneva pere kanalid võivad olla aktiveeritavad kindlate [[Lipiidid|lipiididelipiidid]]e, lenduvate anesteetikumide, kuumuse, hapniku, prootonite või membraanipingega.<ref name="g4jjK" />
* Valgustõkestatavad kanalid avanevad valguse toimel. Näiteks üherakulistel vetikatel on kanalrodopsiin, mis osaleb [[Valgus|valgusevalgus]]e [[Aisting|aistimises]] ja valgusele reageerimises.
 
* Valgustõkestatavad kanalid avanevad valguse toimel. Näiteks üherakulistel vetikatel on kanalrodopsiin, mis osaleb [[Valgus|valguse]] [[Aisting|aistimises]] ja valgusele reageerimises.
 
* [[Pinge (mehaanika)|Mehaanilise pinge]] tundlikud ioonikanalid (MSC – ''mechanosensitive channels'') avanevad ja sulguvad venimise, rebenemise, rõhumuutuse ja nihke (ingl ''displacement'') tulemusel. Mikroorganismides on see kasutuses sensoorse andurina rakusuuruse reguleerimiseks. Nende funktsionaalset tähtsust näitab ka fakt, et E. coli'l on 5 erinevat MSC-d.<ref name="oLvJe" />
* Tsükliliste nukleotiidide tõkestatavad ioonikanalid.
* Temperatuurtõkestatud ioonikanalid avanevad reaktsioonina külmale või soojale temperatuurile. Näiteks TRPV1 avaneb, kui temperatuur tõuseb paar kraadi üle 35 &nbsp;°C, ja TRPM8 avaneb järsult, kui temperatuur langeb alla 25 &nbsp;°C.<ref name="8sNAM" />
 
=== Klassifikatsioon paiknemise järgi ===
Ioonikanalid võivad asuda nii rakku ümbritseval plasmamembraanil kui ka rakusiseste organellide membraanil. Kuna plasmamembraan moodustab vaid ~2% tervest raku membraanist, siis ülejäänud 98% on rakusiseste [[Organell|organellideorganell]]ide koostises (nt [[endoplasmaatiline retiikulum]], [[Golgi kompleks]], [[mitokonder]] ja [[kloroplast]]). Selle alusel jagatakse ioonikanalid kaheks:
* Plasmamembraani kanalid paiknevad raku plasmamembraanis.
* Rakusisesed kanalid, mida klassifitseeritakse organellide järgi.
** Endoplasmaatilise retiikulumi kanalid: sealhulgas RyR, SERCA, ORAi, IP3R, PERK.<ref name="KpuU3" />
** Mitokondri kanalid: sealhulgas mPTP, KATP, BK, IK, CLIC5 ja Kv7.4k, mis paiknevad sisemisel membraanil, ning välimise membraani kanalid VDAC ja CLIC.<ref name="8lR9L" />
** Kloroplasti kanalid: [[Tülakoid|tülakoiditülakoid]]i ioonikanalid.<ref name="ocNcq" />
 
== Ioonikanali blokeerijad ==
66. rida ⟶ 64. rida:
konotoksiin – neurotoksiline valk, mida toodab [[koonustigu]]. Eri tüübid võivad mõjutada näiteks naatriumkanaleid, kaaliumkanaleid ning pingeseoselisi naatrium- ja kaltsiumkanaleid;
 
lidokaiin ja novokaiin – kasutatakse lokaalanesteetikumidena näiteks [[Hambaravi|hambaravishambaravi]]s, blokeerivad naatriumkanaleid;<ref name="Kq0Bq" />
 
dendrotoksiinid – klass presünaptilisi neurotoksiine, mida toodavad [[mamba|mambad]]d, blokeerivad teatud alamtüüpe pingeseoselisi kaaliumkanaleid. [[Must mamba|Musta mamba]] toodetud dendrotoksiin K blokeerib eelistatult Kv1.1 kanaleid ja on aktiivne juba [[Piko-|piko]][[Molaarne kontsentratsioon|molaarsetel kontsentratsioonidel]].<ref name="bOQxY" />
 
==Patoloogia==
74. rida ⟶ 72. rida:
Loomadel (sh inimestel) seostatakse ioonikanalitega hulka haiguslikke seisundeid, nagu kaasasündinud hüperinsulism, [[tsüstneer]]<ref name="74TTa" />, [[tsüstiline fibroos]], Brugada sündroom, mukolipidoos IV.
 
Tsüstilist fibroosi põhjustab ka mutatsioon CFTR-[[Geen|geenisgeen]]is, mis kodeerib tsüstilise fibroosi transmembraanse juhtivuse regulaatorvalku (CFTR), mis on kloriidikanal. Mutatsioon selles geenis häirib kloriidiooni transporti rakust välja. Haiguse korral kattuvad kopsud seest limaga, peamine [[sümptom]] on hingamishäired. Kahjustada saavad ka maks, pankreas ja seedesüsteem. <ref name=":0" />
 
Brugada sündroomi põhjustavad mutatsioonid pingeseoselises naatriumkanalis. Sümptomiteks on ventrikulaarne arütmia, sünkoop ja südameseiskumine, mis leiavad aset peamiselt kas magades või puhates. On täheldatud ka eelnevate sümptomiteta südame äkksurma. <ref name="ZkcoL" />
 
Mukolipidoos IV põhjustavad mutatsioonid TRMPML1 kanalit kodeerivas geenis. Sümptomiteks on arengu mahajäämus ja progresseeruv nägemiskahjustus.<ref name="F347h" />
 
Närvisüsteemi haigustest seostatakse eri ioonikanalite düsfunktsiooniga [[Epilepsia|epilepsiatepilepsia]]t, episoodilist ataksiat, auraga migreeni, Eatoni-Lamberti sündroomi, [[Alzheimeri tõbi|Alzheimeri tõbe]], [[Parkinsoni tõbi|Parkinsoni tõbe]], [[Skisofreenia|skisofreeniatskisofreenia]]t, ekstrapüramidaal- ja liigutushäireid, müotoonilisi haigusseisundeid jpt.
 
Episoodilise ataksia tüübid 1 ja 2: esimest tüüpi põhjustavad mutatsioonid KCNA1 geenis, mis kodeerib pingeseoselist kaaliumkanalit KV1.1. Teist tüüpi põhjustavad mutatsioonid CACNA1A geenis, mis kodeerib pingeseoselist kaltsiumkanalit.
 
== Viited ==
{{viited|allikad=
<ref name=":0">Tsüstiline fibroos http://www.asperbio.com/et/asper-reprogenetics-testid-2/tsustiline-fibroos/</ref>
<ref name="manZg">[[Ain Heinaru]], "Geneetika" õpik kõrgkoolile, Tartu Ülikooli Kirjastus, lk 1009, 2012, ISBN 978-9949-32-171-1</ref>
<ref name="ce5aQ">Hille, B. (2001). ''Ion channels of excitable membranes'' (Vol. 507). Sunderland, MA: Sinauer. <nowiki>http://pub.ist.ac.at/Pubs/courses/2012/introductiontoneuroscience1/docs/Lectures%20May%2013,15/Hille_Ion%20Channels%20of%20Excitable%20Membranes_Chapter1.pdf</nowiki></ref>
106. rida ⟶ 103. rida:
<ref name="8lR9L">Madamba, S. M., Damri, K. N., Dejean, L. M., & Peixoto, P. M. (2015). Mitochondrial ion channels in cancer transformation. ''Frontiers in oncology'', ''5'', 120.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4455240/</ref>
<ref name="ocNcq">Pottosin, I., & Dobrovinskaya, O. (2015). Ion channels in native chloroplast membranes: challenges and potential for direct patch-clamp studies. ''Frontiers in physiology'', ''6''.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4686732/</ref>
<ref name=":0">Tsüstiline fibroos http://www.asperbio.com/et/asper-reprogenetics-testid-2/tsustiline-fibroos/</ref>
<ref name="Kq0Bq">Koorits, U (2006). Lokaalanesteetikumid hambaravis. http://www.hambaarst.ee/artiklid/633/</ref>
<ref name="bOQxY">Harvey, A. L., & Robertson, B. (2004). Dendrotoxins: structure-activity relationships and effects on potassium ion channels. ''Current medicinal chemistry'', ''11''(23), 3065–3072.http://www.eurekaselect.com/62870/article</ref>
120. rida ⟶ 118. rida:
* Huber SM., [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23357407 Oncochannels. Lühikokkuvõte.], Cell Calcium. 2013 apr; 53 (4): 241–255. doi: 10.1016/j.ceca.2013.01.001. Epub 26. jaanuar 2013
* [http://hmg.oxfordjournals.org/content/11/20/2435.full Ion channel diseases], Hum. Mol. Genet. (2002) 11 (20): 2435–2445., doi: 10.1093/hmg/11.20.2435, veebiversioon (vaadatud 04.07.2014)<small> (''inglise keeles'')</small>
* [http://neuromuscular.wustl.edu/mother/chan.html ION CHANNELS, TRANSMITTERS, RECEPTORS & DISEASE], veebiversioon (vaadatud 04.07.2014)<small> (''inglise keeles'')</small>
 
[[Kategooria:Biofüüsika]]