Esimeses voorus sai Allar Jõks 83 häält, Siim Kallas 81 häält, Mailis Reps 79 häält, Marina Kaljurand 75 häält ja Mart Helme 16 häält.
Pärast esimese vooru lõppu avaldas SDE esimees Jevgeni Ossinovski arvamust, et Keskerakonna esimees Edgar Savisaar olevat tegutsenud mitte Keskerakonna kandidaadi Mailis Repsi, vaid Siim Kallase toetuseks: "Tõsi on see, et Edgar Savisaar on Mailis Repsi tagant hääli ära viinud. Ja ka vahepealsel ajal üsna aktiivselt saginud selle nimel, et Siim Kallasele toetust otsida, mis on kindlasti üsna ootamatu." Repsi ja KE fraktsioonijuhi Kadri Simsoni sõnul eelistas Edgar Savisaar Kallast Jõksile ning ka Keskerakonna peasekretär Oudekki Loone nimetas Kallast Keskerakonnale sobivamaks kandidaadiks. Siiski jäetud Keskerakonna liikmete valik vabaks.<ref>[http://uudised.err.ee/v/eesti/40ba1fd3-c440-4105-9e42-205a96ecce0a/ossinovski-naib-et-savisaar-on-repsi-haaled-kallase-taha-viinud Ossinovski: näib, et Savisaar on Repsi hääled Kallase taha viinud] ERR, 24.09.2016</ref> Samamoodi kinnitas SDE liikmete vaba valikut Jaak Allik, kes ennustas kolmandaks vooruks kuni 20 tühja sedelit, ning EKRE liikmete kohta Martin Helme, kes lubas ise sedeli tühjaks jätta.<ref>[http://uudised.err.ee/v/eesti/f232aa50-29cf-42d2-9f4d-85ea9ce10604/jaak-allik-tuhje-sedeleid-tuleb-kuni-20 Jaak Allik: tühje sedeleid tuleb kuni 20] ERR, 24.09.2016</ref>
