RNA polümeraas: erinevus redaktsioonide vahel

Eemaldatud sisu Lisatud sisu
JLuige (arutelu | kaastöö)
JLuige (arutelu | kaastöö)
47. rida:
----
======Initsiatsioon======
Promootor on see DNA järjestus, millele RNA polümeraas seondub ning initsieerib geeni transkriptsiooni. Mitmete geenide promootorjärjestuses on defineeritud kuuenukleotiidilised konsensuselemendid, mis paiknevad transkriptsiooni startsaidist positsioonides -10 ja -35. RNA polümeraas võtab promootoriga seondudes enda alla ligi 60 nukleotiidi pikkuse ala, kusjuures σ-faktor seondub spetsiifiliselt -35 ja -10 regioonidega. σ-faktori puudumisel seondub RNA polümeraas promootoriga ebaspetsiifiliselt ja madala afiinsusega. Leidub erinevaid σ-faktoreid, mis tunnevad ära teatud tüüpi promootoreid. Näiteks σ70σ<sup>70</sup> on ''E. coli''s ekspresseeritud pidevalt ning selle ülesandeks on koduhoidjate geenide (''housekeeping genes'') promootorite äratundmine; σ32σ<sup>32</sup> vastutab ''heat-shock''-geenide promootorite äratundmise eest.
 
Polümeraasi seondumist promootoriga nimetatakse suletud kompleksiks, kuna DNA lahtikeerdumist toimunud ei ole. Polümeraas avab DNA kaksikheeliksi 15 lämmastikaluse ulatuses ning moodustub avatud kompleks. Pärast esimeste nukleotiidide ühinemist ja RNA-ahela pikenemist umbes 10 nukleotiidi võrra, vabaneb σ¬-faktor polümeraasi küljest.
 
Polümeraasi seondumist promootoriga nimetatakse suletud kompleksiks, kuna DNA lahtikeerdumist toimunud ei ole. Polümeraas avab DNA kaksikheeliksi 15 lämmastikaluse ulatuses ning moodustub avatud kompleks. Pärast esimeste nukleotiidide ühinemist ja RNA-ahela pikenemist umbes 10 nukleotiidi võrra, vabaneb σ¬-faktor polümeraasi küljest.
======Elongatsioon======
Elongatsiooni käigus liigub RNA polümeraas mööda DNA-d. Polümeraasi ees toimub DNA lahtikeerdumine ning ensüümi taga keerdub DNA-ahel tagasi kokku. Tekkivat struktuuri nimetatakse transkriptsioonimulliks. RNA ja DNA vaheline paardumisala on kuni 3 nukleotiidipaari.