Redaktsioon: 9. oktoober 2013, kell 01:11 redigeeri Kaarel~etwiki (arutelu \| kaastöö) 253 muudatust Uus lehekülg: 'thumb\|250px\|"Elu puu", ilmestamaks horisontaalset ja vertikaalset geeniülekannet. '''Horisontaalne geeniülekanne '''ehk '''horisontaal...'		Redaktsioon: 10. oktoober 2013, kell 19:37 redigeeri eemalda Iifar (arutelu \| kaastöö) Administraatorid 76 120 muudatust PResümee puudub Uuem muudatus →
2. rida: '''Horisontaalne geeniülekanne '''ehk '''horisontaalne geenisiire '''on [[geneetiline_info\|geneetilise informatsiooni]] kandumine ühest [[organism]]ist teise muul viisil kui läbi traditsioonilise [[paljunemine\|paljunemise]]. Nimetatakse ka lateraalseks geeniülekandeks, vastandudes vertikaalsele, kus [[geen]]ide ülekandmine toimub vanempõlvkonnalt järglastele läbi [[seksuaalne paljunemine\|seksuaalse]] või [[seksuaalne_paljunemine\|aseksuaalse]] [[sigimine\|sigimise]]. On näidatud, et horisontaalne geeniülekanne on oluliseks faktoriks paljude organismide [[evolutsioon]]is. Horisontaalne geeniülekanne on peamiseks [[bakter]]ite [[antibiootikumresistentsus]]e põhjuseks<ref>OECD, ''Safety Assessment of Transgenic Organisms, Volume 4: OECD Consensus Documents,'' 2010, pp.~~171-174~~171–174</ref><ref>{{cite journal \|author=Kay E, Vogel TM, Bertolla F, Nalin R, Simonet P \|title=In situ transfer of antibiotic resistance genes from transgenic (transplastomic) tobacco plants to bacteria \|journal=Appl. Environ. Microbiol. \|volume=68 \|issue=7 \|pages=3345–51 \|year=2002 \|month=July \|pmid=12089013 \|pmc=126776 \|url=http://aem.asm.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=12089013}}</ref><ref>{{cite journal \|author=Koonin EV, Makarova KS, Aravind L \|title=Horizontal gene transfer in prokaryotes: quantification and classification \|journal=Annu. Rev. Microbiol. \|volume=55 \|pages=709–42 \|year=2001 \|pmid=11544372 \|doi=10.1146/annurev.micro.55.1.709 \|url=http://arjournals.annualreviews.org/doi/full/10.1146/annurev.micro.55.1.709?url_ver=Z39.88-2003&rfr_id=ori:rid:crossref.org&rfr_dat=cr_pub%3dpubmed}}</ref><ref>{{cite journal \|author=Nielsen KM \|title=Barriers to horizontal gene transfer by natural transformation in soil bacteria \|journal=APMIS Suppl. \|volume=84 \|pages=77–84 \|year=1998 \|pmid=9850687 }}</ref> ja mängib olulist rolli nende võimes lagundada uusi ühendeid. Näiteks inimese poolt loodud [[pestitsiid\|keemilisi taimekaitsevahendeid]].<ref>{{cite journal \|author=McGowan C, Fulthorpe R, Wright A, Tiedje JM \|title=Evidence for interspecies gene transfer in the evolution of 2,4-dichlorophenoxyacetic acid degraders \|journal=Appl. Environ. Microbiol. \|volume=64 \|issue=10 \|pages=4089–92 \|year=1998 \|month=October \|pmid=9758850 \|pmc=106609 \|url=http://aem.asm.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=9758850}}</ref> Horisontaalses geeniülekandes osalevad tihti mõõdukad [[bakteriofaagid]] ja [[plasmiid]]id.<ref>{{Cite journal \|author=Naik GA, Bhat LN, Chpoade BA, Lynch JM \|title=Transfer of broad-host-range antibiotic resistance plasmids in soil microcosms \|journal=Curr. Microbiol. \|volume=28 \|year=1994 \|pages=209–215 \|doi=10.1007/BF01575963 \|issue=4}}</ref> Geenid, mis vastutavad antibiootikumresistentsuse eest ühes bakteriliigis, kanduvad üle teistele [[liik]]idele läbi erinevate mehhanismide (näiteks F-pilide kaudu). See on muutumas laialdaseks probleemiks meditsiinis ning üheks oluliseks põhjuseks, miks patsiendid ei tohiks antibiootikume manustada ilma arsti vastava retseptita.<ref>{{cite book \|first=Peter J. \|last=Russell \|title=Biology : exploring the diversity of life\|year=2009\|publisher=Nelson Education\|location=Toronto\|isbn=0-17-644094-1\|url=http://www.coursesmart.com/biology-exploring-the-diversity-of-life-1st/russell-wolfe-hertz-starr-fenton-addy-maxwell/dp/9780176440947\|edition=1st Canadian}}</ref> 8. rida: Viimastel aastatel on kindlaks tehtud, et bakterite vahel toimub horisontaalne geeniülekanne palju sagedamini kui varem arvati. Seetõttu on [[geneetik]]ud hakanud vertikaalse ülekande kõrvalt sellele ka järjest enam tähelepanu pöörama.<ref name="edwards">{{cite web\|url=http://www.physorg.com/news205389256.html\|title=Horizontal gene transfer in microbes much more frequent than previously thought\|author=Lin Edwards\|date= October 4, 2010\|publisher=PhysOrg.com\|accessdate=2012-01-06}}</ref><ref name="arnold">{{cite web\|url=http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=to-share-and-share-alike\|title=To Share and Share Alike: Bacteria swap genes with their neighbors more frequently than researchers have realized\|author=Carrie Arnold\|date= April 18, 2011\|publisher=Scientific American\|accessdate=2012-01-06}}</ref> Kunstlik ~~horistontaalne~~horisontaalne geeniülekanne on põhiliseks tööriistaks [[geenitehnoloogia]]s. ==Ajalugu== 61. rida: Horisontaalne geeniülekanne on võimalikuks segavaks faktoriks fülogeneesipuude konstrueerimisel ühe geeni järjestuse järgi.<ref name="Lawton">Graham Lawton ''[http://www.newscientist.com/article/mg20126921.600-why-darwin-was-wrong-about-the-tree-of-life.html?page=1 Why Darwin was wrong about the tree of life]'' [[New Scientist]] Magazine issue 2692 21 January 2009 Accessed February 2009</ref> Näiteks kui kaks omavahel kaugelt suguluses olevat bakterit vahetavad geeni, siis neid liike sisaldaval puul märgitakse nad lähedasteks sugulasteks, kuna võrdluse aluseks olev geen on identne. Seda isegi siis, kui ülejäänud geenid on erinevad. Seetõttu on tihti parem kasutada teistsugust informatsiooni fülogeneesipuudelt järelduste tegemiseks, nagu geenide olemasolu või puudumise hindamine ja kaasata fülogeneetilisse analüüsi võimalikult lai valik geene. Enimlevinud geeniks, mille põhjal koostatakse prokarüootide fülogeneetilisi suhteid, on 16S [[Ribosomaalne_RNA\|rRNA]] geen. Selle järjestused on küllalt konserveerunud lähedaste sugulaste määramiseks, kuid samas piisavalt muutuvad, et erinevusi mõõta. Viimastel aastatel on arutletud, et ka need geenid võivad horisontaalselt ~~ülekanduda~~üle kanduda. Ehkki see võib toimuda harva, tuleks siiski 16S rRNA põhjal konstrueeritud fülogeneesipuid uuesti hinnata.<ref>[http://ijs.sgmjournals.org/content/55/3/1021.full Genomic analysis of Hyphomonas neptunium contradicts 16S rRNA gene-based phylogenetic analysis: implications for the taxonomy of the orders ‘Rhodobacterales’ and Caulobacteral...]</ref> Bioloog Johann Peter Gogarten soovitab, et hiljutiste genoomianalüüside valguses tuleks traditsiooniline "puu" asendada "mosaiigiga", mis kirjeldaks erineva ajalooga geenide kombinatsiooni genoomides. Ning "võrk" oleks sobivaks metafooriks visualiseerimaks tihedat geeniülekannet mikroobide vahel. Kasutades üksikuid geene fülogeneetiliste markeritena on horisontaalse geeniülekande tõttu raske ~~jälgide~~jälgida organismi fülogeneesi. ==Geenid==

Horisontaalne geeniülekanne: erinevus redaktsioonide vahel