Kasutaja:Kaarel~etwiki/Horisontaalne geeniülekanne: erinevus redaktsioonide vahel

Eemaldatud sisu Lisatud sisu
Resümee puudub
Resümee puudub
57. rida:
==Tähtsus evolutsioonis==
[[Image:Elu_puu.jpg|thumb|right|250px|Fülogeneetiline elu puu 16s rRNA subühiku analüüsi alusel.]]
Horisontaalne geeniülekanne on võimalikuks segavaks faktoriks fülogeneesipuude konstrueerimisel ühe geeni järjestuse järgi.<ref name="Lawton">Graham Lawton ''[http://www.newscientist.com/article/mg20126921.600-why-darwin-was-wrong-about-the-tree-of-life.html?page=1 Why Darwin was wrong about the tree of life]'' [[New Scientist]] Magazine issue 2692 21 January 2009 Accessed February 2009</ref> Näiteks kui kaks omavahel kaugelt suguluses olevat bakterit vahetavad geeni, siis neid liike sisaldaval puul märgitakse nad lähedasteks sugulasteks, kuna võrdluse aluseks olev geen on identne. Seda isegi siis kui ülejäänud geenid on erinevad. Seetõttu on tihti parem kasutada teistsugust informatsiooni fülogeneesipuudelt järelduste tegemiseks, nagu geenide olemasolu või puudumise hindamine ja kaasata fülogeneetilisse analüüsi võimalikult lai valik geene.
 
Enimlevinud geeniks, mille põhjal koostatakse prokarüootide fülogeneetilisi suhteid, on 16S [[Ribosomaalne_RNA|rRNA]] geen. Selle järjestused on küllalt konserveerunud lähedaste sugulaste määramiseks, kuid samas piisavalt muutuvad, et erinevusi mõõta. Viimastel aastatel on arutletud, et ka need geenid võivad horisontaalselt ülekanduda. Ehkki see võib toimuda harva, tuleks siiski 16S rRNA põhjal konstrueeritud fülogeneesipuid uuesti hinnata.<ref>[http://ijs.sgmjournals.org/content/55/3/1021.full Genomic analysis of Hyphomonas neptunium contradicts 16S rRNA gene-based phylogenetic analysis: implications for the taxonomy of the orders ‘Rhodobacterales’ and Caulobacteral...]</ref>
 
Bioloog Johann Peter Gogarten soovitab, et hiljutiste genoomianalüüside valguses tuleks traditsiooniline "puu" asendada "mosaiigiga", kirjeldamaks erineva ajalooga geenide kombinatsiooni genoomis ning "võrku", et visualiseerida tihedat geeniülekannet mikroobide vahel.
68. rida:
Leidub tõendeid, et ajalooliselt on toimunud horisontaalset ülekannet järgmiste geenide puhul:
 
* Lükopeeni tsüklaas, mis on vajalik karotenoidide [[biosüntees]]iks, rohelise [[väävlibakterid|väävlibakteri]] ja [[tsüanobakterid|tsüanobakteri]] vahel.<ref>
{{cite journal
|author=D.A. Bryant & N.-U. Frigaard
|month=November
|year=2006
|title=Prokaryotic photosynthesis and phototrophy illuminated
|journal=Trends Microbiol.
|volume=14
|issue=11
|pages=488–96
|doi=10.1016/j.tim.2006.09.001
|pmid=16997562
}}</ref>
 
* TetO geen, mis annab resistentsuse [[tetratsükliin]]ile, ''Campylobacter jejuni'' vahel.<ref>{{cite journal |author=Avrain L, Vernozy-Rozand C, Kempf I |title=Evidence for natural horizontal transfer of tetO gene between ''Campylobacter jejuni'' strains in chickens |journal=J. Appl. Microbiol. |volume=97 |issue=1 |pages=134–40 |year=2004 |pmid=15186450 |doi=10.1111/j.1365-2672.2004.02306.x |url=http://onlinelibrary.wiley.com/resolve/openurl?genre=article&sid=nlm:pubmed&issn=1364-5072&date=2004&volume=97&issue=1&spage=134}}</ref>
* TetO geen, mis annab resistentsuse [[tetratsükliin]]ile, ''Campylobacter jejuni'' vahel.
 
==Vaata ka==