Nagaoka-kyō (長岡京) oli Jaapani pealinn aastatel 784–794.
Varasem pealinn oli Heijō-kyō, kust keiser Kammu selle ära kolis, sest Nagaoka-kyō oli veetranspordi suhtes paremas asukohas.
794 liigutas keiser Kammu pealinna Kyōtosse, kuhu see jäi kuni 1869. aastani.