|
[[Pilt:TRNA-Phe yeast 1ehz.png|thumb|rightpisi|180px|tRNA molekuli ruumiline struktuur]]
'''Transport-RNA''' ehk '''tRNA''' on [[RNA|ribonukleiinhape]], mis tegeleb [[rakk|rakus]] [[aminohapped|aminohapete]] transpordiga [[ribosoom|ribosoomi]]i, kus [[geneetiline kood|geneetilise koodi]] alusel lisatakse [[aminohapped|aminohape]] sünteesitavasse [[valk|valguahelasse]].
Nagu teisedki [[RNA]] molekulid, on tRNA [[molekul]] [[polümeer]], ning koosneb [[nukleotiid|nukleotiididest]]idest – [[adeniin]]ist ('''A'''), [[guaniin]]ist ('''G'''), [[tsütosiin]]ist ('''C''') ja [[uratsiil]]ist ('''U'''), lisaks ka mõnest modifitseeritud [[nukleotiid|nukleotiidist]].
tRNA molekulide pikkus varieerub 74 nukleotiidist 92-ni (on üksikuid molekule, mis on mõnevõrra lühemad või pikemad).
tRNA avastati [[1950. aastad|1950. aastate]] lõpul. Sellest ajast alates on tRNA olnud üks uuritumaid [[biomolekul]]e. Ta on ka esimene [[biomolekul]], mille [[ruumiline struktuur|ruumilist struktuuri]] tundma õpiti. Tänapäeval on teada tuhandete tRNA molekulide [[primaarstruktuur]] paljudes eri [[liik (bioloogia)|liikides]]. Kõigi tuntud tRNA molekulide ruumiline struktuur on nii [[sekundaarstruktuur|sekundaar-]] kui ka [[tertsiaarstruktuur]]i tasemel väga sarnane.
== Struktuur ==
tRNA molekulide [[sekundaarstruktuur]]isekundaarstruktuuri iseloomustatakse "ristikheinalehe" kujuga. tRNA [[sekundaarstruktuur]]isekundaarstruktuuri moodustavad 4 kaksikahelalist osa - õlga ja 4 üksikahelalist piirkonda - lingu, mis paiknevad vastavate õlgade otstes.
tRNA molekuli otsad asuvad lähestikku, nende paardumisel tekkiv kaksikahelaline osa kannab nimetust "aktseptor-õlg", selle [[3' ots|3' otsa]]a paardumata nukleotiididele liidetakse [[esterside|estersidemega]]mega [[aminohape]]. Aktseptor-õlg on 7 [[aluspaar]]i pikk.
T-õlg (ka TψC õlg) on saanud oma nime tänu modifitseerunud [[nukleotiid|nukleotiididele]], mis asuvad T-lingus. Need nukleotidid on [[ribosüültümidiin]] '''T''' ja [[pseudouridiin]] '''ψ'''. T-õla pikkus on 5 [[aluspaar]]ialuspaari, T-lingu pikkus varieerub harilikult 7-9 [[nukleotiid|nukleotiidi]] ulatuses.
D-õlg on saanud nime temas leiduva modifitseeritud nukleotiidi [[dihüdrouridiin]]i '''D''' järgi. D-õla pikkus on harilikult 4 [[aluspaar]]ialuspaari, D-lingu pikkus on varieeruv.
Antikoodon-õlg on alati 5 [[aluspaar]]ialuspaari pikk ja nagu nimestki on näha, sisaldab antikoodoni ling kolmest nukleotiidist antikoodonit mis vastab [[mRNA]] [[koodon|koodonile]]ile. Antikoodoni lingus on alati 7 [[nukleotiid]]inukleotiidi.
Lisaks neile võivad paljud tRNA molekulid sisaldada lisalingu ja lisaõlga, mille pikkus võib olla suuresti varieeruv.
== Funktsionaalsus ==
[[Pilt:TRNA_sekundaarstrukt.png|thumb|rightpisi|260px|tRNA molekuli tasapinnaline struktuur]]
Funktsionaalselt on tRNA molekuli tähtsaim osa antikoodon, mille kolm [[nukleotiid]]inukleotiidi paarduvad [[komplementaarsusprintsiip (geneetika)|komplementaarsusprintsiibi]] alusel mRNA [[koodon|koodoniga]], mis on geneetilise [[translatsioon]]i ja [[geneetiline kood|geneetilise koodi]] strukturaalseks aluseks. Seetõttu on antikoodoni lingu ruumiline konformatsioon oluline täpse koodon-antikoodon seondumise toimumiseks. Antikoodoni ees paikneb [[bimolekulide konserveerumine|konserveerunud]] U33 [[nukleotiid]], mille järel teeb tRNA ahel järsu pöörde. [[Nukleotiid]] 34, esimene antikoodoni [[nukleotiid]] paardub [[mRNA]] [[koodon]]ikoodoni viimase, 3. [[nukleotiid]]iganukleotiidiga ja seetõttu on oluline, et koodon-antikoodon seondumine lõppeks just 34. nukleotiidiga ega jätkuks U33 ga, niiviisi määrab tRNA ahelas toimuv järsk pööre ära koodoni pikkuse (3 [[aluspaar]]ialuspaari). Antikoodon on sobivas ruumilises struktuuris [[mRNA]] [[koodon]]iga paardumiseks. Antikoodoni järel paiknevad nn. [[hüpermodifitseeritud nukleotiidid]], mis pole võimelised aluspaare moodustama, nii on tagatud [[translatsioon]]i täpsus.
tRNA teine oluline piirkond, [[3' ots]], paikneb aktseptor-õla otsas. tRNA kolm viimast [[nukleotiid|nukleotiidi]] on CCA järjestus, mis [[ribosoom]]isribosoomis seondub valguahela [[peptiidside]]me moodustumist [[katalüüs|katalüüsiva]]iva piirkonnaga. tRNA 3' otsa seotakse ka [[ensüüm]] [[aminoatsüül-tRNA ligaas]]i vahendusel [[esterside|estersidemega]]mega vastav [[aminohape]]. Olgugi, et paljudele [[aminohapped|aminohapetele]] vastab mitu erinevat tRNAd, vastab igale erinevale tRNAle vaid üks konkreetne [[aminoatsüül-tRNA ligaas]]. [[Aminoatsüül-tRNA ligaas]] tunneb tRNA ära vastavate tRNA identsuse elementide järgi, milleks on kindlad, erinevatele tRNA molekulidele ainuomased [[nukleotiid]]idnukleotiidid antikoodoni lingus ja aktseptoorses õlas. Valgusünteesi käigus [[ribosoom]]isribosoomis lahutatakse tRNA antikoodoni ja mRNA koodoni paardumisel [[aminohapped|aminohape]] tRNAst ja lisatakse [[valk|valguahelasse]].
tRNA esineb rakus kolme vormina:
* Aminoatsüül-tRNA, tRNA, mille [[3' ots|3' otsa]] on seotud [[aminohapped|aminohape]].
* Peptidüül-tRNA, tRNA variant, mis esineb ainult [[ribosoom|ribosoomis]] [[valgu biosüntees|valgusünteesi]] käigus; peptidüül-tRNA [[3' ots|3' otsa]] on veel seotud [[aminohapped|aminohape]], mis on omakorda juba moodustanud [[peptiidside|peptiidsideme]]me sünteesitava [[valk|valguahelaga]].
* Deatsetüleeritud tRNA, "tavaline" tRNA, tRNA millele pole [[aminohapped|aminohapet]] seotud.
==Vaata ka==
*[[geeniekspressioon]]
*[[geneetiline kood]]
*[[RNA]]
*[[translatsioon]]
[[Kategooria:Valkude biosüntees]]
| 