Pöördtranskriptaas: erinevus redaktsioonide vahel

Eemaldatud sisu Lisatud sisu
Tlkkio (arutelu | kaastöö)
Parandasin teksti keeleliselt, kui ka tõlkimisel tekkinud sisulised vead. Korrastasin ülesehitust. Osa teksti vajab veel korrigeerimist, samuti viited.
Tlkkio (arutelu | kaastöö)
PResümee puudub
5. rida:
 
Enim uuritud pöördtranskriptaasid:
* HIV-1 pöördtranksriptaas, mis on pärit inimese [[HIV|immuunpuudulikkuse]] tüüp 1 viiruselt (PDB: 1HMV),ning koosneb kahest subühikust [[Molekulmass|molekulmassidega]] 66 kDA ja 51kDa51 kDa<ref>Ferris, AL; Hizi, A; Showalter, SD; Pichuantes, S; Babe, L; Craik, CS; Hughes, SH (April 1990). "Immunologic and proteolytic analysis of HIV-1 reverse transcriptase structure." (PDF). Virology. 175 (2): 456–64. PMID 1691562. doi:10.1016/0042-6822(90)90430-y.</ref>
* M-MLV pöördtranskriptaas Moloney hiire [[leukeemia]] viirusest, mis on üksiküksiku 75kDa75 kDa-lise [[monomeer|monomeerina]]<ref>Konishi A, Yasukawa K, Inouye K (2012). "Improving the thermal stability of avian myeloblastosis virus reverse transcriptase α-subunit by site-directed mutagenesis". Biotechnol. Lett. 34 (7): 1209–15. PMID 22426840. doi:10.1007/s10529-012-0904-9</ref>
* AMV pöördtranskriptaas linnu müeloblastoosi viirusest, mis koosneb samuti kahest subühikust ,molekulmassidega 63kDa63 kDa ja 95kDa95 kDa
* [[Telomeraas|Telomeraasi]] pöördtranskriptaas, mis takistab kromosoomi otsade lagunemist pärast mitmeid replikatsioone
 
16. rida:
Pöördtranskriptaasi kasutavad viirused replikatsioonil. Pöördtranskribeerivad [[RNA-viirused]] (näiteks [[HIV|HI-viirus]]) kasutavad ensüümi, et pöördtranskribeerida oma RNA genoom DNA-ks. Vastav DNA on võimalik seejärel integreerida peremeesorganismi genoomi ning läbi selle saab viirus enda genoomi replitseerida. Pöördtranskribeerides [[DNA-viirused|DNA-viiruseid]], näiteks [[Hepadnaviirus|hepadnaviirust]], on võimalik kasutada saadud RNA-d matriitsahelana uute DNA ahelate kokkupanemisel. Pöördtranskriptaasi puudumisel ei oleks viirused võimelised enda genoomi replitseerima. <ref name=":0" />
 
===Pöördtranskriptsiooni protsess===
Pöördtranskriptaas kasutab RNA matriitsahelat, et sünteesida kaheahelaline DNA. Viirustes, kus pöördtranskriptaasil on puudu DNA-sõltuv DNA polümeraasne aktiivsus, on võimalus, et kaheahelalist DNA-d sünteesitakse peremeesorganismi kodeeritud [[DNA polümeraasid|DNA polümeraas δ]] abil. See toimib, kuna polümeraas ekslikult tuvastab viraalse DNA-RNA kui [[Praimer|praimeri]] ning sünteesib kaheahelalise DNA samal mehhanismil nagu praimeri eemaldamiselgi, kus uus sünteesitud ahel vahetab välja originaalse RNA matriitsi. Pöördtranskriptsiooni puhul on vigade ehk mutatsioonide tekkimise tõenäosus suur ja seega on see põhiline protsess, mis põhjustab [[Ravimiresistentsus|ravimresistentsust]].<ref name=":1" />
 
====Retroviiruste pöördtranskriptsioon====
[[Retroviirused]] kasutavad pöördtranskriptaasi üheahelalise genoomse RNA transkribeerimiseks kaheahelaliseks cDNA-ks, et see integreerida peremeesgenoomi. Nende genoom koosneb kahest positiivse laenguga üheahelalisest RNA molekulist (ss-RNA ehk ''single-stranded RNA''), millel on 5’-''cap'' ja 3’-polüadenenüleeritud saba. Retroviirusteks on näiteks inimese immuunpuudulikkuse viirus ([[HIV]]) ja inimese [[T-lümfotroopne viirus]] (HTLV). Kaheahelalise DNA süntees toimub [[Tsütosool|tsütosoolis]]<ref name=":0">Bio-Medicine.org - Retrovirus Retrieved on 17 Feb, 2009</ref> järgmiste protsesside tulemusena:
[[Fail:Reverse_transcription.svg|pisi|Pöördtranskriptsiooni mehhanism VI klassi ssRNA-RT HI-viiruses]]
30. rida:
# Toimub “hüpe”, kus teiselt ahela PBS hübridiseerub esimese ahela komplementaarse PBS-järjestusega.
# Mõlemad ahelad pikendatakse, et moodustada täielik kaksikahelaline DNA, mida on võimalik [[Integraal|integraasi]] abil integreerida peremeesorganismi genoomi.
Kaheahelalise DNA sünteesi käigus toimub ka ahela ülekanne, mil lühike DNA (algse RNA-sõltuva DNA sünteesi produkt) translokeerub aktseptor-regiooni genoomi teises otsas. Pöördtranskriptaas töötleb seda ala hiljem tänu oma DNA-sõltuvale DNA aktiivsusele.<ref name=":1">Telesnitsky A., Goff S. P. (1993). "Strong-stop strand transfer during reverse transcription". In Skalka, M. A.; Goff, S. P. Reverse transcriptase (1st ed.). New York: Cold Spring Harbor. p. 49. ISBN 0-87969-382-7.</ref> Retroviraalse RNA praimeri seondumise ala nimetatakse praimeri seondumisalaks (PBS). PBS regiooni 5' otsas on U5 ning 3' otsas paikneb "juhtiv" ala. tRNA praimer ei seondu 14. ja 22. nukleotiidi vahel ning loob aluspaarduva dupleksi viraalse RNAga PBS alas. PBS asukoht 5’-otsa piirkonnas viraalsel RNA-l on ebatavaline, kuna pöördtranskriptaas sünteesib DNAd praimeri 3’-otsast 5’-3’-suunas (vaadeldes RNA matriitsi). Seega praimer ja pöördtranksriptaas peavad olema relokeerunud 3’-otsa viraalsel RNAl. Selleks ümberpaigutumiseks on vaja mitut etappi ja erinevaid ensüüme, sh DNA polümeraas, ribonukelaas H (RNaas H) ja polünukleotiidide lahtikeerdumine.<ref>Bernstein A., Weiss R., Tooze J. (1985). "RNA tumor viruses". Molecular Biology of Tumor Viruses (2nd ed.). Cold Spring Harbor, N.Y.: Cold Spring Harbor Laboratory.</ref><ref>Moelling, K; Broecker F. (2015) The reverse transcriptase–RNase H: from viruses to antiviral defense. Ann N Y Acad Sci. 1341:126-35. doi: 10.1111/nyas.12668.</ref>
 
HI-viiruse pöördtranskriptaas omab samuti ribonukleaasset aktiivsust, mis lagundab cDNA sünteesi käigus viraalse RNA. Lisaks on HIV pöördtranskriptaasil DNA-sõltuv DNA polümeraasne aktiivsus, mis kopeerib cDNA senssahela antisenss-DNA ahelaks, et sünteesida kaheahelaline viraalse DNA vaheühend vDNA.<ref>Doc Kaiser's Microbiology Home Page > IV. VIRUSES > F. ANIMAL VIRUS LIFE CYCLES > 3. The Life Cycle of HIV Community College of Baltimore County. Updated: Jan 2008.</ref>