Erinevus lehekülje "DNA polümeraasid" redaktsioonide vahel

P
resümee puudub
P (parandasin skripti abil kriipsud + Korrastasin skripti abil viiteid)
P
DNA polümeraas liidab [[Nukleotiidid|nukleotiide]] DNA 3’ otsa ühe nukleotiidi kaupa.
 
Iga kord, kui rakk jaguneb, aitab DNA polümeraas raku DNA-d duplitseerida, et esialgse DNA molekuli koopia kanduks edasi [[Tütarrakk|tütarrakule]]. SelliselSel viisil saab geneetilist infot põlvest põlve edasi anda.
Enne kui replikatsioon saab toimuda, harutab ensüüm nimega [[Helikaasid|helikaas]] DNA molekuli [[Biheeliks|biheeliksi]] lahti, lõhkudes lämmastikaluste vahel olevad [[Vesinikside|vesiniksidemed]]. Selle protsessi käigus hargneb DNA kaheks üksikahelaks, mida saab replikatsioonil kasutada matriitsahelana.
 
DNA polümeraas liigub moodustuval ahelal vastupidiselt matriitsahelal liikumise suunaga. Juhtival ahelal liigub DNA polümeraas 3’-5’ suunal ja mahajääv ahel moodustatakse 5’-3’ suunal. See erinevus võimaldab saada kaheahelalise DNA molekuli, mille kaks ahelat on omavahel antiparalleelsed.
 
DNA polümeraas teeb umbes ühe vea iga miljardi aluspaari kohta. Osad DNA polümeraasid suudavad neid vigu parandada, kuid mitte kõik. Selle protsessi käigus parandatakse viga juurdesünteesitud DNA ahelas. Vale aluspaari äratundmise puhul liigub DNA polümeraas ühe aluspaari võrra DNA-l tagasi. Ensüümi 3’-5’ [[eksonukleaasne aktiivsus]] lubab vale aluspaari välja lõigata – seda tuntakse ka ''proofreading'''u nime all. PealePärast seda sisestab polümeraas õige aluspaari ja replikatsioon jätkub. Sellega tagatakse, et info esialgselt DNA ahelalt jõuab samal kujul tütarrakkudesse.
 
DNA replikatsioonis on täpsus väga oluline. Lämmastikaluste valepaardumised võivad aluse anda mittefunktsionaalsetele valkudele, mis omakorda võivad viia [[vähk (haigus)|vähi]] tekkeni. Mitmed DNA polümeraasid omavad eksonukleaaset domääni, mis tuvastab valestipaardumised ning asendab vale nukleotiidi õigega.<ref name="jiN9i" />
 
== Struktuur ==
Teadaolevatel DNA polümeraasidel on kõrgelt konserveerunud struktuur, mis tähendab, et nende katalüüsivad subühikud varieeruvad liikide vahel väga vähe. Konserveerunud struktuurid viitavad tavaliselt tähtsatele ja asendamatutele rakufunktsioonidele, mis tagavad evolutsioonilised eelised. Polümeraasi kuju sarnaneb paremaleparema käelekäega, koosnedes pöidla, sõrme ja peopesa domeenidest. Peopesa domeen on aktiivtsenter, mille funktsiooniks on katalüüsida fosfaatrühma ülekannet. DNA on seotud peopesa domeeniga, kui ensüüm on aktiivne. Seda reaktsiooni katalüüsivad kahevalentsed metalliioonid. Sõrme domeeni funktsiooniks on siduda nukleosiidtrifosfaadid esialgse lämmastikaluse külge. Pöidla domeen mängib rolli protsessiivsusel, translokatsioonil ja DNA positsioneerimises.<ref name="pwTJ0" />
 
== Liikidevaheline varieeruvus ==
| Y || Replikatiivsed ja reparatsioonipolümeraasid || Eukarüootides ja prokarüootides || Pol IV, Pol V
|-
| RT || Replikatiivsed ja reparatsioonipolümeraasid || Viirustes, retroviirustes ja eukarüootides || [[Telomeraas]], B -hepatiidi viirus
|}
 
 
=== Pol I ===
Prokarüootide A polümeraaside hulka kuulub DNA polümeraas I (Pol I) ensüüm, mida kodeerib ''polA'' geen ja mis on prokarüootide seas üldlevinud. See parandusomadustega polümeraas osaleb parandamisel nii 3’-5’ kui ka 5’-3’ suunal eksonukleasse aktiivsusega ja [[Okazaki fragment|Okazaki fragmentide]] protsessimisel maha jääva ahela sünteesil.<ref name="3e0IP" /> Pol I on kõige kõrgema aktiivsusega, võttes näiteks bakteris ''[[E. coli]]'' enda alla > 95% polümerassest aktiivsusest. Rakud, millel puudub Pol I, suudavad Pol I aktiivsuse asendada mõne teisega nelja polümeraasi seast. Pol I lisab umbes 15–20 nukleotiidi sekundis, mis näitab üsna madalat protsessiivust. Pol I alustab nukleotiidide lisamist seega RNA [[Praimer|praimerist]] – replikatsiooni alguspunktist, mida nimetatakse ori piirkonnaks. Sellest umbes 400 aluspaari eespool assembleeritakse holoensüüm Pol III, mis võtab replikatsiooni suure protsessiva kiirusega üle.<ref name="1rUPF" />
 
=== Pol II ===
 
=== Pol IV ===
DNA polümeraas IV teeb ''E. coli''-<nowiki/>'s palju vigu ja on seotud mittespetsiiflisemittespetsiifilise [[mutagenees]]iga.<ref name="F9zG6" /> Pol IV kuulub Y polümeraaside alla, mida ekspresseerib dinB geen. See lülitakse sisse SOS-induktsioonis, mida põhjustab replikatsioonikahvlis seisma jäänud polümeraas. Selle protsessi käigus suureneb polümeraas IV tootmine kümme korda. Lisaks on üheks funktsiooniks segada Pol III ensüümi protsessiivsust. See loob kontrollpunkti, peatades replikatsiooni ja võimaldades parandada DNA kahjustused.<ref name="5dLdJ" /> Rakkudel, millel puudub dinB geen, esineb DNA-d kahjustavate ainete tõttu rohkem mutatsioone.<ref name="TIQ5U" />
 
=== Pol V ===
114 047

muudatust