[[Eukarüoot]]ide [[genoom]]is on üldiselt mitu koopiat rRNA geene organiseeritud [[Tandeemne kordus|tandemkordus]]tesse, näiteks inimestel – 300–400 kordust asuvad viies klastris ([[kromosoom]]ides [[13. kromosoom|13]], [[14. kromosoom|14]], [[15. kromosoom|15]], [[21. kromosoom|21]] ja [[22. kromosoom|22]]). Kokkuvõtvalt kutsutakse rDNA geeniklastreid ribosomaalseks DNA-ks nende erilise struktuuri ja transkriptsioonilise käitumise tõttu.
rRNA osakaal päristuumsete ribosoomides on umbes 60%. 18S rRNA on enamikesenamikus [[Eukarüoot |päristuumsetes]] väikese alaühiku komponent. Suur alaühik sisaldab kolme rRNA osakest – 5S, 5.8S ja kolmas, varieeruv rRNA (näiteks 28S imetajates, 25S taimedes). 28S, 5.8S ja 18S rRNAsid kodeerib üks transkript (45S). 45S rDNA on organiseeritud viide klastrisse kromosoomides 13, 14, 15, 21 ja 22, iga klastrit on 30–40 kordust. Neid klastreid [[Transkriptsioon_(geneetika)|transkripteerib]] RNA polümeraas I – ehk viib läbi rRNA sünteesi [[tuumake]]ses. Tuumake on osa rakutuumast, mis on spetsialiseerunud rRNA sünteesile ja rRNA assambleerimisele ribosoomidesse. Võib öelda, et tuumake on organell, mis moodustub tänu ribosoomide formeerumise protsessile. Tuumake moodustub ribosomaalse RNA (rRNA) geene sisaldavate kromosoomilõikude ümber (kromosoomides 13, 14, 15, 21 ja 22).<ref name="molbio" /> 5S rRNA esineb tandemkordustena, suurim neist asub kromosoomis 1, asukohas q41–42. 5S rRNAd transkripteerib RNA polümeraas III (asub rakutuumas).
Lisaks tsütoplasmas asuvatele ribosoomidele on päristuumsetel ribosoomid ka [[mitokonder|mitokondrites]]. Mitokondriaalsed rRNAd imetajates on 12S (väike alaühik) ja 16S (suur alaühik).
