Alates [[2006]]. aastast on mitmed Soome teadlased seisukohta, et Susiluolast avastatud esemeid saab seostada neandertallastega, tugevalt kritiseerinud. Muu hulgas on arvatud, et kiviesemed ei sarnane piisavalt mujalt leitud keskpaleoliitikumi tööriistadega ja võivad olla hoopis looduslikku päritolu, et koobas asus terve jäävaheaja jooksul allpool veepinda ning et polepõlemisele kindlaidviitavad tõendeidjäljed kivimitel ei pruugi tähendada, et seal tuld tehti. Koobast uurinud arheoloogid on oma seisukohti kaitsnud.<ref>Kõige intensiivsem diskussioon on aset leidnud ajakirjades [[Tietessä tapahtuu]] (aastatel 2004–2007, numbrid on leitavad ajakirja kodulehelt: [http://www.tieteessatapahtuu.fi/]) ning [[Fennoscandia Archaeologica]] (aastatel, 2005, 2007 ja 2008: [http://www.sarks.fi/fa/faxxii.html] ; [http://www.sarks.fi/fa/faxxiv.html] ; [http://www.sarks.fi/fa/faxxv.html]).</ref> Seetõttu pole teadlaste seas endiselt üksmeelt, kas Susiluolas oli neandertallaste asulakoht või mitte.<ref> [http://www.iltasanomat.fi/kotimaa/art-2000001253239.html Iltasanomat: Pohjanmaan neandertalilaisten arvoitus yhä auki – kiistellyn Susiluolan kaivaukset vaatisivat rahaa] ; [http://www.horisont.ee/node/1167 Neandertallaste jäljed põhjanaabrite maal. Horisont 4/2009]</ref>
