Metsade fragmenteerumine on elupaikade killustumine<ref>[[Elupaiga fragmenteerumine]]</ref>, mis esineb, kui metsi raiutakse maha nii, et alles jäävad võrdlemisi väiksed isoleeritud osad metsast, mida kutsutakse metsa fragmentideks. Vahepealne maatriks, mis eraldab metsa fragmente võib olla füüsiliselt avatud ala, põllumaa või arenenud inimasustusega piirkond. Järgides saarte biogeograafia<ref>[[:en:Insular_biogeography|https://en.wikipedia.org/wiki/Insular_biogeography]]</ref> mõistet käituvad metsade jäänukid justkui metsa saared keset põllumerd. Nendes kildudes hakkab toimuma ökosüsteemi lagunemine.
