CK2: erinevus redaktsioonide vahel
Eemaldatud sisu Lisatud sisu
PResümee puudub |
P parandasin skripti abil kriipsud + muu |
||
1. rida:
{{keeletoimeta}}
'''Proteiini kinaas CK2 (EC 2.7.11.1)''', tuntud ka kui '''kaseiinkinaas II''', on [[seriin]]i/[[treoniin]]i proteiinkinaas, mis on laialt levinud [[eukarüootne rakk|eukarüootsetes rakkudes]] ja omab arvukaid füsioloogilisi funktsioone.<ref name="focus" >Kramerov, A. A.; Ljubimov, A. V. Focus on Molecules: Protein kinase CK2. Exp. Eye Res., 2012, 101,
== Struktuur ==
[[Pilt:CK2holoensuum.png|pisi|CK2 holoensüümi 3D struktuur]]
16. rida ⟶ 11. rida:
Hiljuti inimrakus avastatud katalüütilise alaühiku CK2α’′ kohta on infot suhteliselt vähe. CK2α’′ aminohappelise järjestuse kohaselt on CK2α’′ struktuurilt suhteliselt sarnane CK2α-ga, nimelt mõlema katalüütilise alaühiku esimesed 353 aminohapet, väljaarvatud 127. asend (CK2α Thr ja CK2α’′ Ala), on CK2α ja CK2α’′ identsed.<ref name="life" /> CK2α ja CK2α’ katalüütiliste alaühikute sarnasuse uurimiseks katsetati hiirte CK2α’ kodeeringut sisaldava geeni ''knockout''-i (meetod, kus organismis muudetakse üks geen mittetöötavaks). [[Heterosügoot]]se ja [[homosügoot]]se hiire paaritamisel saadi elujõulised järglased, mis viitab, et CK2α on võimeline kompenseerima CK2α’-i, kui arvestada vaid järglaste elujõulisust. Kuid katsest ilmnes ka, et selliste hiirte isased järglased olid steriilsed, mis näitab, et CK2α ei ole täielikult võimeline kompenseerima funktisonaalsust CK2α’-i puudumisel.<ref name="life" />
Erinevalt katalüütilistest alaühikutest ei ole regulatoorsel CK2β alaühikul ulatuslikke sarnasusi teiste proteiinidega.<ref name="focus" /> β-alaühik on unikaalne proteiin, imetajatel kodeerib seda vaid üks geen, erinevalt katalüütilistest alaühikutest.<ref>Boldyreff, B.; O. G. Issinger. Structure of the gene encoding the murine protein kinase CK2 subunit. Genomics, 1995, 253–256.</ref> CK2β-l on holoensüümi kompleksis mitu ülesannet. <ref name="mice" >Buchou, T.; Vernet, M.; Blond, O.; Jensen, H. H.; Pointu, H.; Olsen, B. B.; Cochet, C.; Issinger, O.-G.; Boldyreff. Distribution of the Regulatory β Subunit of Protein Kinase CK2 in Mice Leads to a Cell-Autonomous Defect and Early Embryonic Lethality. Mol. Cell. Biol., 2003,
==Regulatsioon rakkudes ==
30. rida ⟶ 23. rida:
# assotsiatsioon katalüütilise ja regulatoorse alaühiku vahel, mis võimaldab taasaktiveerida, kui interaktsioon N-terminaali ja aktivatsioonsegmentide vahel on katkenud.
Ohtrate aktivatsioonimehhanismide tõttu on nii CK2 holoensüüm kui ka isoleeritud alaühikud pidevalt aktiivsed.<ref name="cannons" /> CK2 on enamasti klassifitseeritud kui virgatsainetest sõltumatu (inglise keeles ''messenger-independent'') kinaas, sest selle aktiivsus ei sõltu väikestest molekulidest, nagu tsüklilised [[nukleotiid]]id, [[lipiid]]id ja [[kaltsium]], mis on seotud informatsioonist sõltuvate [[kinaas]]idega. <ref>Mishra, S.; Pertz, V.; Zhang, P.; Shimada, K. H.; Groffen, J.; Kazimierczuk, Z.; Pinna, L.A.; Heisterkamp, N. Treatment of P190 Bcr/Abl lymphoblastic leukemia cells with inhibitors of the serine/threonine kinase CK2. Leukemia, 2006, 21,
==Funktsioon ==
CK2 on proteiinkinaas, mis aksepteerib fosforüülrühma [[doonor]]ina võrdselt hästi nii [[Adenosiintrifosfaat|ATP]]-d kui ka [[GTP]]-d. CK2 kannab üle fosforüülrühma seriini ja treoniini jääkidele, kuid on võimeline ka fosforüleerima [[türosiin]]i, kuigi palju madalama efektiivsusega. <ref name="focus" /> Kõige hämmastavam proteiinkinaas CK2-e omadus on selle pleiotroopsus (palju funktsioone, substraate) ning seetõttu on see eluliselt tähtis: proteiinkinaas CK2 on seotud väga erinevate mehhanismidega, ehk isegi kui kõik need mehhanismid üksikult pole asendamatud, siis kõikide nende mehhanismide välja jätmine oleks fataalne. <ref name="cannons" >Pinna, L. Protein Kinase CK2: a Challenge to Canons. J. Cell. Sci., 2002, 115,
CK2 on atsidofiilne proteiinkinaas, tundes ära negatiivselt laetud aminohappeid sisaldavaid substraate.<ref>M. Montenarh, Cell Tissu Res., 2012, 342,
CK2 poolt äratuntava valgu sidumiskoha konsensusjärjestus on:
45. rida ⟶ 35. rida:
(E/D/x)-(S/T/Y)-(E/D/x’)-(E/D/x)-(E/D)-(E/D/x),
kus S/T/Y – fosforüülrühma aktseptor, x -mittepositiivne aminohappe jääk, x’
==CK2-e patogeeniline potensiaal==
57. rida ⟶ 46. rida:
CK2-e liiga kõrge aktiivsus on seotud ka mitmete põletikuliste ning südame-, närvi- ja veresoonkonna haigustega. Lisaks on avastatud, et CK2 seostub ka mitmete viiruslike valkudega. <ref name="uri" >Uri, A.; Enkvist, E.; Viil, I.; Lavogina, D.; Raidaru, G.-J.; Viht, K. Bisubstrate fluorescent probe binding to protein kinases. US 8,158,376 B2, 2012.</ref>
==CK2 inhibiitorid ==
64. rida ⟶ 52. rida:
Tuntakse kolme eri tüüpi proteiinkinaaside [[inhibiitor]]eid.
*Esimest tüüpi inhibiitorid on [[Adenosiintrifosfaat|ATP]]-konkurentsed inhibiitorid. Need ühendid toimivad kui [[adeniin]]i matkijad, konkureerides ATP sidumiskohale. Selliste inhibiitorite peamiseks probleemiks on madal selektiivsus ja konkureeriva ATP kõrge kontsentratsioon rakukeskkonnas. Välja on töötatud mitmed erinevad CK2-e ATP-konkurentsed inhibiitorid, näiteks 4,5,6,7-tetrabromobensimidasool (TBB).
*Teist tüüpi proteiinkinaaside inhibiitorid hõlmavad ühendeid, mis selektiivselt häirivad proteiin-proteiin interaktsioone ja blokeerivad substraadi sidumise proteiinkinaasi aktiveeritud taskusse.<ref name="uri" />
*Kolmandaks tüübiks on bisubstraatsed inhibiitorid, mis koosnevad kahest konjugeeritud fragmendist, millest kumbki seondub erinevasse bisubstraatse [[ensüüm]]i seondumistaskusse.
CX-4945 on esimene kliinilistes katsetustes olev CK2-e selektiivne inhibiitor. Kasvajarakkude jälgimine katsete I faasis on näidanud kasvajarakkude suremust CX-4945 toimel, mis tõestab, et CX-4945 on stabiilne ja kestev ravitoime.<ref>www.cylenepharma.com/pipeline/ck2-program </ref>
[[Tartu Ülikool]]is Asko Uri[http://www.ut.ee/medchem/about-us] uurimisgrupi poolt välja arendatud [[ARC-tüüp]]i proteiinkinaasi bisubstraatsed inhibiitorid on arvatavasti kõige põhjalikumalt uuritud bisubstraatsed inhibiitorid. ARC-id on konjugaadid, mis koosnevad adenosiisin matkivast ühendist ja oligo-arginiinist.<ref>Lavogina, D.; Enkvist, E.; Uri, A. Bisubstrate Inhibitors of Protein Kinases: from Principle to Practical Applications. ChemMedChem, 2010, 5, 23–34. </ref>
|