Erinevus lehekülje "Transformatsioon (geneetika)" redaktsioonide vahel

resümee puudub
Umbes 1% bakteriliikidest on loomulikult kompetentsed, olles võimelised laborikeskkonnas ilma lisatöötluseta vaba DNA-d oma rakku võtma.
On alust arvata, et looduslikus keskkonnas on see protsent suurem. Kui DNA kandub yle yhelt bakterityvelt teisele, nimetatakse seda
horisontaalseks geeniylekandeks, mis on geneetilise materjali saamine teiselt organismilt, olemata selle järglane. <ref name="test"> [http://en.wikipedia.org/wiki/Horizontal_gene_transfer Horisontaalne geeniylekanne] .</ref> Lähedaste liikide vahel toimib transformatsioon paremini kui evolutsiooniliselt kaugemate liikide puhul. Looduslikult kompetentsetes bakterites on olemas geenikomplektid, mis kodeerivad DNA transmembraanseks transpordiks vajalikke valke, näiteks DNA translokaasi komplekse tsytoplasmamembraanis <ref>[Chen I, Dubnau D (2004). "DNA uptake during bacterial transformation". Nat. Rev. Microbiol. 2 (3): 241–9. doi:10.1038/nrmicro844. PMID 15083159].</ref> ja tyyp IV kiudude kokkupanekuks tarvilikke valke.
 
Tulenevalt Gram-positiivsete ja Gram-negatiivsete bakterite rakukesta erinevustest esineb mõningaid erinevusi viisis, kuidas täpselt bakterid
rakuvälist DNA-d enda sisse toovad, kuid yldjoontes on protsess siiski sarnane. Esmalt seondub DNA kompetentse raku pinnal paiknevale DNA
retseptorile ning liigub DNA translokaasi abil läbi rakumembraani. <ref>[Lacks, S.; Greenberg, B.; Neuberger, M. (1974). "Role of a Deoxyribonuclease in the Genetic Transformation of Diplococcus pneumoniae". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 71 (6): 2305–2309. PMC 388441. PMID 4152205].</ref> Selle käigus lagundatakse selle yks ahel nukleaaside poolt, kuna rakku
pääseb vaid yheahelaline DNA. Sellist yheahelalist DNA-d on RecA ehk rekombinaas A abil võimalik genoomi integreerida. Gram-negatiivsed bakterid
vajavad oma rakukesta mitmekihilise ehituse tõttu valgulist kanalit ka välisesse membraani, mille moodustavad sekretiinid. Arvatakse ka, et oma roll
on piliinil, kuid selle funktsiooni kohta pole veel kuigi palju teada. <ref>[Long, C. D.; Tobiason, D. M.; Lazio, M. P.; Kline, K. A.; Seifert, H. S. (2003). "Low-Level Pilin Expression Allows for Substantial DNA Transformation Competence in Neisseria gonorrhoeae". Infection and immunity 71 (11): 6279–6291. PMC 219589. PMID 14573647].</ref> DNA transport rakku pole enamasti järjestuse-spetsiifiline, ent mõnede
liikide puhul võivad kindlad järjestused rakuvälises DNA-s seda kergendada. <ref>[Sisco, K. L.; Smith, H. O. (1979). "Sequence-specific DNA uptake in Haemophilus transformation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 76 (2): 972–976. PMC 383110. PMID 311478. editFull text at PMC: / 383110].</ref>
 
====Kunstlik kompetentsus====
28

muudatust